Die Geschichte geht nun etwas mehr auf die familiäre Situation der Charaktere ein. So wird Sayaka beim Besuch eines Schulfreundes im Krankenhaus gezeigt. Kyōsuke Kamijō liegt dort schon längere Zeit in einem geschwächten Zustand und kann seinen Körper und insbesondere seine Hände nach einem Unfall nicht mehr richtig bewegen. Dabei war er zuvor ein bewunderter Violinspieler und kann sich nicht mit der Situation abfinden, dass er sie vermutlich nie wieder spielen könne. Mami auf einer weiteren Exkursion begleitend können sie ihr nun teilweise ihren Wunsch entlocken. Dabei muss sie zugeben, dass sie nicht viel Zeit hatte darüber nachzudenken, schließlich sei sie in einem Verkehrsunfall verwickelt gewesen. Dies nutzt Mami aber zugleich um Sayaka über die Grundvorraussetzungen für die richtige Formulierung des Wunsches zu informieren. Der Wortlaut des Wunsches ist nämlich essentiell, damit er sich am Ende nicht als schlechte Entscheidung herausstellt. Später in der Nacht unterhält sich Madoka mit ihrer betrunkenen Mutter und ihrem Vater, um sich mit ihnen zu beraten, ohne jedoch den wahren Grund ihres Anliegens preiszugeben. Zugleich tritt Homura an Mami heran und warnt auch sie davor Madoka sich in ein Magical Girl verwandeln zu lassen. Abermals kann sie aber nicht richtig begründen, warum sie das nicht dürfe. Am nächsten Tag, bei einem erneuten Besuch von Kyōsuke, bemerken Madoka und Sayaka einen Grief Seed, der sich nah am Eingang des Krankenhauses befindet. Da der Grief Seed schon kurz vor der Aktivierung steht, beschließen sie, dass Madoka Hilfe holen soll, während Sayaka zusammen mit Kyubei die Parallelwelt betrifft, damit sie von der Unterstützung gefunden werden könne. Als Madoka mit Mami als Verstärkung zurückkehrt, stößt ebenfalls Homura dazu, die Mami vor dieser Hexe zu warnen gesucht, da sie etwas besonderes sei. Mami der dies überhaupt nicht gefällt, nutzt hingegen ihre magischen Fähigkeiten um Homura festzusetzen und folgt zusammen weiter mit Madoka der Spur zu Sayaka. Auf dem Weg berichtet Madoka davon, dass es ihr einziges Wunsch wäre sich in ein Magical Girl zu verwandeln um anderen Menschen zu helfen. Mami lehnt dies jedoch ab, da es sie nur dazu verleitet hätte einsam und ängstlich zu sein. Da Madoka ihr jedoch anbietet von nun an an ihrer Seite zu sein, fühlt sie sich sichtlich erleichtert. Als sich der Grief Seed aktiviert muss sich Mami zunächst mit dem kleineren Gefolge der Hexe auseinandersetzen. Beim Kampf gegen die eigentliche Hexe scheint es zunächst so, dass Mami die Oberhand hat und die Hexe zur Strecke gebracht wurde. Diese verwandelt sich aber in etwas wie eine riesige Raupe und erwischt damit Mami völlig unvorbereitet, die in diesem Moment durch einen Biss ihren Kopf verliert. Homura kann nur ahnen was geschehen ist, als sich die Fesseln von Mami lösen und versucht schnellstmöglich Madoka und Sayaka zu helfen. Sie ihrerseits kann die Hexe vollkommen überraschen, da sie sich scheinbar teleportieren kann und sie mit explosiven Waffen von innen heraus zur Strecke bringt. Während Homura den Grief Seed für sich beansprucht, stehen Madoka und Sayaka durch den Tod Mamis sichtlich unter Schock.
